Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms