Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5Y3

CAMSAP1, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP1Q5T5Y3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CAMSAP1Q5T5Y3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms