Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms