Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms