Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf46Q504U0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms