Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GREB1Q4ZG55 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GREB1Q4ZG55 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GREB1Q4ZG55 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GREB1Q4ZG55 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GREB1Q4ZG55 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GREB1Q4ZG55 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GREB1Q4ZG55 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GREB1Q4ZG55 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GREB1Q4ZG55 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GREB1Q4ZG55 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GREB1Q4ZG55 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GREB1Q4ZG55 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GREB1Q4ZG55 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GREB1Q4ZG55 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GREB1Q4ZG55 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GREB1Q4ZG55 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GREB1Q4ZG55 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GREB1Q4ZG55 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GREB1Q4ZG55 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GREB1Q4ZG55 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms