Protein–RNA interactions for Protein: Q49MI3

CERKL, Ceramide kinase-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKLQ49MI3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CERKLQ49MI3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CERKLQ49MI3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms