Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms