Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC96Q2M329 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms