Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ISXQ2M1V0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms