Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms