Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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