Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSRP2Q16527 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CSRP2Q16527 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CSRP2Q16527 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP2Q16527 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP2Q16527 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP2Q16527 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP2Q16527 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP2Q16527 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP2Q16527 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP2Q16527 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP2Q16527 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP2Q16527 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP2Q16527 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP2Q16527 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP2Q16527 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP2Q16527 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP2Q16527 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP2Q16527 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP2Q16527 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP2Q16527 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP2Q16527 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP2Q16527 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP2Q16527 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP2Q16527 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP2Q16527 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSRP2Q16527 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSRP2Q16527 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSRP2Q16527 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSRP2Q16527 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
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