Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMA4Q16363 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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