Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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