Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms