Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms