Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3CQ15386 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
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