Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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PTPRRQ15256 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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PTPRRQ15256 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
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