Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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