Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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