Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
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