Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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