Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
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