Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ITGA9Q13797 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms