Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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