Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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