Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE3BQ13370 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE3BQ13370 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
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