Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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SP140Q13342 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP140Q13342 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP140Q13342 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP140Q13342 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP140Q13342 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP140Q13342 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP140Q13342 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP140Q13342 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP140Q13342 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP140Q13342 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP140Q13342 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP140Q13342 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP140Q13342 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP140Q13342 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP140Q13342 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SP140Q13342 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP140Q13342 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP140Q13342 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP140Q13342 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SP140Q13342 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP140Q13342 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP140Q13342 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP140Q13342 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP140Q13342 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP140Q13342 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP140Q13342 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP140Q13342 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP140Q13342 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SP140Q13342 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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SP140Q13342 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SP140Q13342 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SP140Q13342 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SP140Q13342 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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SP140Q13342 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SP140Q13342 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SP140Q13342 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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SP140Q13342 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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SP140Q13342 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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SP140Q13342 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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SP140Q13342 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SP140Q13342 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SP140Q13342 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SP140Q13342 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SP140Q13342 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SP140Q13342 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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SP140Q13342 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SP140Q13342 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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SP140Q13342 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SP140Q13342 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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SP140Q13342 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SP140Q13342 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SP140Q13342 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SP140Q13342 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SP140Q13342 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SP140Q13342 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SP140Q13342 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SP140Q13342 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SP140Q13342 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SP140Q13342 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SP140Q13342 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SP140Q13342 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SP140Q13342 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP140Q13342 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP140Q13342 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP140Q13342 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP140Q13342 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP140Q13342 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP140Q13342 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP140Q13342 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP140Q13342 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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