Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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