Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
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