Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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