Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms