Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STX4Q12846 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STX4Q12846 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
STX4Q12846 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
STX4Q12846 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
STX4Q12846 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
STX4Q12846 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
STX4Q12846 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
STX4Q12846 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
STX4Q12846 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
STX4Q12846 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
STX4Q12846 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
STX4Q12846 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
STX4Q12846 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
STX4Q12846 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
STX4Q12846 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
STX4Q12846 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
STX4Q12846 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
STX4Q12846 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
STX4Q12846 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
STX4Q12846 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
STX4Q12846 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
STX4Q12846 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
STX4Q12846 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
STX4Q12846 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
STX4Q12846 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
STX4Q12846 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
STX4Q12846 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
STX4Q12846 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
STX4Q12846 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
STX4Q12846 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
STX4Q12846 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
STX4Q12846 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
STX4Q12846 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STX4Q12846 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STX4Q12846 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STX4Q12846 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
STX4Q12846 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STX4Q12846 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STX4Q12846 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STX4Q12846 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STX4Q12846 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STX4Q12846 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STX4Q12846 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STX4Q12846 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STX4Q12846 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STX4Q12846 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STX4Q12846 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STX4Q12846 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STX4Q12846 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STX4Q12846 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
STX4Q12846 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
STX4Q12846 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
STX4Q12846 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
STX4Q12846 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
STX4Q12846 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STX4Q12846 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STX4Q12846 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
STX4Q12846 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STX4Q12846 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STX4Q12846 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
STX4Q12846 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STX4Q12846 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STX4Q12846 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STX4Q12846 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
STX4Q12846 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
STX4Q12846 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
STX4Q12846 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
STX4Q12846 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
STX4Q12846 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
STX4Q12846 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
STX4Q12846 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
STX4Q12846 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
STX4Q12846 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
STX4Q12846 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
STX4Q12846 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
STX4Q12846 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
STX4Q12846 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
STX4Q12846 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
STX4Q12846 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
STX4Q12846 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
STX4Q12846 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
STX4Q12846 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
STX4Q12846 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
STX4Q12846 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
STX4Q12846 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
STX4Q12846 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
STX4Q12846 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
STX4Q12846 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
STX4Q12846 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
STX4Q12846 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
STX4Q12846 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
STX4Q12846 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
STX4Q12846 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
STX4Q12846 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
STX4Q12846 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
STX4Q12846 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
STX4Q12846 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
STX4Q12846 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
STX4Q12846 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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