Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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