Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms