Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms