Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms