Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms