Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms