Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms