Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC42EP1Q00587 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms