Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms