Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDK3Q00526 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK3Q00526 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms