Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC5Q00444 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms