Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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FAM3AP98173 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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FAM3AP98173 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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FAM3AP98173 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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FAM3AP98173 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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FAM3AP98173 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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FAM3AP98173 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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FAM3AP98173 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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FAM3AP98173 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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FAM3AP98173 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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FAM3AP98173 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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