Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
EFNB1P98172 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms