Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms