Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBA52P62987 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBA52P62987 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBA52P62987 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBA52P62987 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBA52P62987 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBA52P62987 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBA52P62987 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBA52P62987 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBA52P62987 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBA52P62987 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBA52P62987 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBA52P62987 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBA52P62987 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBA52P62987 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBA52P62987 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBA52P62987 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBA52P62987 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBA52P62987 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBA52P62987 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBA52P62987 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBA52P62987 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBA52P62987 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBA52P62987 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBA52P62987 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBA52P62987 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBA52P62987 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBA52P62987 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBA52P62987 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBA52P62987 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBA52P62987 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBA52P62987 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBA52P62987 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBA52P62987 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBA52P62987 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBA52P62987 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBA52P62987 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBA52P62987 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBA52P62987 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBA52P62987 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBA52P62987 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBA52P62987 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBA52P62987 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBA52P62987 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBA52P62987 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBA52P62987 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBA52P62987 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBA52P62987 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBA52P62987 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBA52P62987 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBA52P62987 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBA52P62987 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBA52P62987 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBA52P62987 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBA52P62987 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBA52P62987 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBA52P62987 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBA52P62987 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms