Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTBP60709 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTBP60709 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTBP60709 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTBP60709 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTBP60709 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTBP60709 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTBP60709 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTBP60709 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTBP60709 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTBP60709 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTBP60709 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTBP60709 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTBP60709 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTBP60709 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTBP60709 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTBP60709 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTBP60709 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTBP60709 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTBP60709 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTBP60709 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTBP60709 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTBP60709 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTBP60709 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTBP60709 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTBP60709 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTBP60709 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTBP60709 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTBP60709 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTBP60709 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTBP60709 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTBP60709 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTBP60709 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTBP60709 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTBP60709 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTBP60709 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTBP60709 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTBP60709 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTBP60709 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTBP60709 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTBP60709 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTBP60709 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTBP60709 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTBP60709 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTBP60709 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTBP60709 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTBP60709 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTBP60709 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTBP60709 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTBP60709 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTBP60709 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTBP60709 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTBP60709 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTBP60709 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTBP60709 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTBP60709 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTBP60709 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTBP60709 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTBP60709 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTBP60709 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTBP60709 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTBP60709 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTBP60709 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTBP60709 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTBP60709 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTBP60709 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTBP60709 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTBP60709 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTBP60709 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTBP60709 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTBP60709 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTBP60709 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTBP60709 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTBP60709 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTBP60709 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTBP60709 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTBP60709 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTBP60709 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTBP60709 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTBP60709 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTBP60709 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTBP60709 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTBP60709 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTBP60709 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTBP60709 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTBP60709 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTBP60709 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTBP60709 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTBP60709 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTBP60709 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTBP60709 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTBP60709 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTBP60709 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTBP60709 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTBP60709 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTBP60709 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTBP60709 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTBP60709 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTBP60709 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTBP60709 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms